Отделение создано в 1946 г. как отдел. С 1951 г. – проектно-исследовательское бюро. С 1960 г. – 1 отделение. С 2012 г. – отделение управления системной интеграцией в области военного кораблестроения. Основной функцией отделения является формирование научно-технических заданий в области судостроения по программам развития оборонно-промышленного комплекса.
Управление системной интеграцией в области военного кораблестроения основывается на идеологии единых конструктивно-технологических платформ:
а также других платформ, приведенных в государственных программах, и включает следующие направления: